南京工业大学电气工程与控制科学学院前身源于南京化工学院1958年成立的化工机械系，1977年开始招生化工自动化及仪表专业，1994年成立自动化与计算机系，后经两校合并组建自动化学院，2008年12月更名为自动化与电气工程学院，2015年4月更名为电气工程与控制科学学院。学院是中国人工智能学会智能检测与运动控制专委会、中国电工技术学会电气工程教育专业委员会、江苏省全国计算机等级考试技术服务中心挂靠单位。

学院以科产学研为特色，不断拓展国内外合作。先后与法国勃艮第大学、澳大利亚昆士兰大学、西班牙萨拉戈萨大学、英国斯旺西大学等知名高校开展研究生、本科生合作培养项目，与意大利国家计量研究院等国际知名院所签订战略合作协议；同时，面向中科院医工所、中科院长光所（滁州）、国电南瑞、浙江中控、上海德衡等国内大院名企，在人才培养、科学研究、社会服务等方面开展全方位产教融合合作。